Margir spá lítið í því að uppfærslur komi fyrir Cydia forrit, en uppfærslur á forritum eða viðbótum þar eru tíðar og nýta sér oft nýjustu möguleika iOS stýrikerfisins að fullu. Til þess að uppfæra forrit í Cydia skaltu gera eftirfarandiSkref 1: Opnaðu Cydia og leyfðu því að hlaða öllum breytingum og nýjungum (tekur oftast 20-60 sekúndur). Smelltu síðan á Changes flipann.
Skref 2: Ef einhverjar uppfærslur eru komnar þá ættu uppfærslurnar að vera afmarkaðar undir Available Upgrades efst á skjánum.
Skref 3: Smelltu á Upgrade efst í hægra horninu til að uppfæra forritin þín.
Skref 4: Nú skaltu endurræsa símann, og þá ætti Cydia að vera uppfært í topp.
Eftirfarandi myndband sýnir einnig hvernig forrit í Cydia eru uppfærð